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中国水稻研究所是一个以水稻为主要研究对象的多学科综合性国家级研究所，以应用基础研究和应用研究为主。
为加强土壤微生物群落的研究，中国水稻研究所引进了迅数全自动菌落计数仪。全自动菌落计数仪在水稻研究所的土壤微生物研究中得到了多方面的应用。专业研究人员利用不同培养状态下的自动菌落计数进行土壤微生物类群分布的定性定量分析，利用仪器的菌落颜色分析进行土壤微生物类群的产色素性状分析，利用仪器的菌落形态分析进行土壤微生物菌落形态性状分析及数据库保存，利用仪器高清晰菌落图片保存进行各类群微生物菌落图谱建立，利用仪器的菌落平均直径自动统计分析和抑菌圈自动测量进行土壤微生物的抗菌活性分析。
